重大疾病医疗救治付费参考标准已商省物价局同意。执行市级收费标准的救治定点医疗机构，付费标准应在省级标准的基础上降低12%左右；执行县级收费标准的救治定点医疗机构，付费标准应在市级标准的基础上降低12%左右，具体付费标准由各市、县（市、区）卫生局结合当地实际与医疗机构协商后确定。
（一）执行省级收费的医疗机构定额付费标准
1、肺癌
（1）肺叶切除术：35000元
（2）全肺切除术：35000元
（3）肺局部切除术：30000元
（4）开胸探查术：30000元
（5）VATS手术：47000元
2、食道癌（食管癌切除消化道重建术）：40000元
3、胃癌（根治术）：37000元
4、结肠癌
（1）根治切除术：32000元
（2）全结肠切除术：35000元
5、直肠癌
（1）低位前切除术：38000元
（2）腹会阴联合切除术：30000元
6、急性心肌梗塞（冠状动脉内支架植入术）
植入1个支架：44000元
植入2个支架：55000元
植入3个及3个以上支架的，所增加的支架费用由患者自理。
7、甲亢（甲状腺次全切除术）：10000元
8、唇腭裂（修复术）
（1）唇裂修复术：5000元
注：由慈善机构资助享受免费医疗待遇的患者，新农合不再予以补偿。
（2）腭裂修复术：7000元
注：由慈善机构资助享受免费医疗待遇的患者，新农合不再予以补偿。
（二）最高限额付费标准
1、慢性粒细胞白血病
门诊口服格列卫治疗的，新农合对每位患者每年3个月用量的药品费用补偿70%，患者自付30％，新农合年最高补偿限额为76865元，另外9个月的格列卫由病人向中华慈善总会提出申请，经审核同意后，由病人到指定的医疗机构免费领取。
2、Ⅰ型糖尿病
执行省级收费的医疗机构：7000元
（三）项目付费
脑梗死、血友病、耐多药肺结核、艾滋病机会性感染、慢性粒细胞白血病（采用门诊口服羟基脲或注射阿糖胞苷＋干扰素治疗的病人），按照本文件按项目付费的规定补偿。