一些药物毒性数据库的使用

来源: 冠勤医药/GoalGenbiotech


在合成过程中,研究人员可能会需要判断哪些杂质需要定入质量标准,定入质量标准的控制限度为多少,因此需要查阅相关化合物的毒性数据,下面介绍一些常用的查询毒性的数据库及各自特点,希望给予研发同仁们一些帮助。

1

Drug future-化学物质毒性数据库


http://www.drugfuture.com/toxic/


RTECS主要包括以下六大类化学物质的毒性数据:

直接刺激性(Primary irritation)

致突变性(Mutagenic effects)

对生殖的影响(Reproductive effects,即致畸性)

致肿瘤性(Tumorigenic effects)

急性毒性(Acute toxicity)

其他多剂量毒性


其中记录有该化学物质的数值毒性值,如半数致死量(LD50或LC50),最低中毒剂量(TDLo),最低中毒浓度(TCLo)等,以及实验所使用的物种和给药途径。除此之外,所有的数据也都列出了其文献来源,然而并没有对其有任何的评估。


该数据库中数据大部分都较为久远,一些较新的化合物不被列入;此外,此数据库查询时会有一些bug,如需查询一个化合物,最好通过不同方式如CAS号,通用名多次查询,因为有些化合物可能通用名查不到,CAS号却能查到。

2

 TOXNET


https://toxnet.nlm.nih.gov/


简介:Toxnet是美国国家医学图书馆(NLM)的化合物毒性相关数据库,包括药品毒理学、危险化学品和其它相关领域的信息,从Toxnet可对下列子数据库进行检索: 

HSDB(危险化合物数据库):内含4500种毒性(或可能具有毒性的)化学药品,以及其毒性、对环境的影响、化学安全性、废弃物处置等相关领域的信息。

TOXLINE®:包括药物和其它化学物质的生物化学、药理学、生理学、毒理学的文献数据库。其中有300万条引文、几乎都有摘要和/或检索条、以及CA登录号。

ChemIDplus:对NLM数据库中的化学物质提供结构式和专业信息。 

IRIS(综合风险信息系统):由美国环保署(EPA)建立的在线数据库,内含500多种化学物的EPA致癌和非致癌性健康危险评估。 

TRI(毒性化学药品的排放调查):内含1995-1999年每年向外界排放的毒性化学药品估计量,其中包括这些化学物质的名称、性状描述,以及排向大气、水域或土地的毒性化学物质量。 

CCRIS(化学致癌作用研究信息系统):内含8,000多种化学物质短期或长期生物分析所得的评估数据及信息。这些分析涉及到致癌物、诱变剂、辅致癌物质和肿瘤启动物质、致癌物的抑制剂和代谢物。

GENE-TOX:内含3,000 多种化学物质的基因毒理学测试结果。 

DART®/ETIC(发展与再生毒理学/环境畸形学信息中心):本库收录了自1950年来发表的有关畸形学和发展毒理学的文献。


一般直接检索,结果会按照子数据库结果分条列出,你选择相关的子数据库结果点击即可。

3

The Carcinogenic Potency Database (CPDB)

https://toxnet.nlm.nih.gov/newtoxnet/cpdb.htm


属于TOXNET的子数据库,包含有1574种致癌物质,还有基因毒性方面的研究,可通过TOXNET查询:


也可直接查看化合物列表:https://toxnet.nlm.nih.gov/cpdb/chemnameindex.html

4

ChemBlink

http://www.chemblink.com/indexC.htm#opennewwindow


提供化合物的安全技术说明书(MSDS),说明书中毒性一栏(Toxicological Information)会提供化合物的一些毒性数据。


首页检索(该数据库检索与Drug future-化学物质毒性数据库类似,需通过CAS号和化学名等多次检索,有时候CAS号搜不出来,化学名可以,如下面CAS号搜索没有结果,但是用化学名Tetrabutylammonium bromide就可以得到结果):


点击安全技术说明书参考文本,会列出不同公司对该化合物的MSDS。

5

摩贝化学

http://zh.molbase.com/?gclid=CMnv2Kj7lM4CFQMrvQodbWQE-A


最初是中科院内部使用的数据平台。其商用版网站摩贝网(MOLBASE)于2013年9月上线,为一个化学品电商综合服务平台。其中包含了化合物的百科信息,内容涵盖了以上介绍的一至多个数据库,如Drugfuture-化学物质毒性数据或MSDS。


该平台的特点就是可以通过化学结构查询化合物,因此可以搜索不知道CAS号的化合物,画结构式的工具简单上手。

搜索完成点击查看百科信息,选择你需要的数据即可。


后记:本人也是刚入行没多久的新手,经过了自己的摸索选择觉得这几个数据库还是比较好用的,希望对大家有所帮助。