最近这些年，因为环境因素致畸的病例开始慢慢上升，临床上看到非常多的不明原因畸形儿基本上都是因为环境因素所造成的。同时还有非常多的在儿童期和青春期发生的疾病也是因为怀孕时期环境问题埋下的隐患。
X射线、微波和嗓音等，尤其是X-射线，在怀孕之前或者是刚刚怀孕的时候最好是不要做多次X线检查，尤其是盆腔或腹部的X线检查，同时也注意最好不要去做放射性同位素的检查和治疗，但小量的偶然一次的X线检查通常情况下是不会对胎儿造成影响的，超声波检查通常情况下也不会对胎儿造成不好的影响。过度的长时间的环境噪音同样也会影响胎儿的生长发育，严重的时候还会造成低体重儿或先天缺陷儿，怀孕的时候最好也不要一直用高温热浴或洗桑拿。
在装修时产生的一部分有毒物质也会对宝宝造成一定的伤害，选择绿色环保材料是必须要的。药物服用要科学合理，在怀孕前或者是刚刚怀孕的时候如果必须用药，那么最好去询问一下医生的意见，但在紧急情况下如退烧药，抗菌素之类的最好是要马上服用，因为高烧和严重感染也会致畸的。
各种病毒性和细菌性感染疾病都要预防，像是预防接种最好孕前三个月完成，风疹病毒，巨细胞病毒，疱疹病毒，肝炎病毒还有弓形虫感染，要是感染了的话，待治疗痊愈后方可妊娠。孕前建议做病毒检查，即优生系列检测，如结果显示有近期感染，那么要等完全好了之后再要孩子，大家要好好注意。
营养因素对胚胎生长发育的影响，主要体现在干扰胚胎生物合成代谢上。例如，维生素A、维生素E、叶酸、锌、碘、铁以及蛋白质等的缺乏，首先会造成胚胎生物合成所必需的基础的缺乏，延缓和干扰生物合成。其次，一些维生素的缺乏，会干扰体内的新陈代谢，使胚胎发育的能量不足，同时，营养不良有可能使胎儿在子宫内生长发育迟缓，主要表现在脑、骨骼等器官的发育上。由于怀孕早期是脑细胞生长发育的第一个关键时期，如果孕妇营养失调，那么给胎儿大脑发育带来的不良影响以后将无法弥补，妈妈还要为胎儿出生后的成长储备必要的营养素。
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