益生菌食物来源
含益生菌的酸奶
在健康状态下，平时可多选择含益生菌的奶制品作为零食，传统的酸奶是由保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌发酵而成，这两种都是益生菌。而添加益生菌的酸奶是在前者的基础上，人工添加了双歧杆菌作为发酵菌种，常喝可起到保健作用，有益健康。但注意要买新鲜低温保存的酸奶。
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含益生菌的配方奶
一些奶粉中加入了益生菌，如双歧杆菌，可以促使肠道更健康。
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含乳酸菌的饮料
如果生病的情况下，要咨询医生是否可以喝含有乳酸菌饮料。
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新鲜乳酪含益生菌
质地柔软的乳酪含有较多的活菌，因此，含有活菌的食材或食品都要冷藏保鲜，也只有活菌才能在肠道里繁殖。
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益生菌制剂
建议在医生或营养师的指导下使用。
益生菌制剂：
不论是摄入粉末还是胶囊态的益生菌补充剂，主要是保证这些益生菌在经过胃、十二指肠时不被胃酸和胆汁等消化液破坏，顺利到达肠道定居。一个人肠内居住的细菌总量最高可达100万亿，这个量比地球上总人口数还大。
补充足够数量的有益菌仅仅是开始，你至少需要100亿的活菌。
益生菌要能够存活且顺利到达肠道，要免受胃酸和胆汁的破环，因此需对益生菌进行特殊处理，一方面其能常温保存，另一方面可免受消化液的破坏，常用方法是对益生菌进行三层包埋：首先是由益生菌、保护剂、碱容性大分子形成第一层保护层，将益生菌包埋初级结构，具有定向缓释作用。将初级结构进行固定化包埋和抗胆汁包埋，形成第二层保护层；外层再包覆耐酸和抗物理因素 (如抗热、击打、震荡、摩擦等 ) 保护层。
其基本原理是：最外层包覆胃酸难降解的生物大分子，保护益生菌在低 pH条件下顺利通过胃部而不失活。十二指肠较高 pH 值，最外层开始迅速崩解溶化，第二层暴露出来，其中含有抗胆汁的物质，保证益生菌不被胆汁灭活。 随着消化作用的继续推进, 最内层包膜迅速崩解, 失去所有包膜的益生菌在各自适宜和营养丰富的肠道中最终靶向定植下来并开始了大量繁殖。
益生菌要在肠道大量繁殖，必需有丰富的营养，对于益生菌来说其食物就是益生元，益生菌与益生元同时补充，可保证益生菌定之后大量增殖，达到改善肠道微生态环境的作用。