微生物的种类和分类
按能量与碳源来源分类
化能异养菌（氧化还原物质获得能量，将有机碳同化为细菌物质，如枯草芽孢杆菌）。
光能异养菌（俘获太阳辐射能为能量，将有机碳同化为细菌物质，如紫色非硫细菌）。
化能自养菌（氧化还原物质获得能量，将无机碳同化为细菌物质，如硝化细菌）。
光能自养菌（俘获太阳辐射能为能量，将无机碳同化为细菌物质，如红硫细菌）。
按电子受体分类
好氧菌（以氧气作为最终电子受体，如枯草芽孢杆菌）。
厌氧菌（以有机小分子或无机氧化物作为最终电子受体）。
以有机小分子做电子受体，如乳酸杆菌。
以氮氧化物做电子受体，如脱氮杆菌。
以铁氧化物做电子受体，如铁还原菌。
以锰氧化物做电子受体，如锰还原菌。
以硫氧化物做电子受体，如脱硫杆菌。
以二氧化碳做电子受体，如沼气产生菌。
兼性好氧菌（有氧时以氧气为最终电子受体，无氧时以无机氧化物作为最终电子受体）。
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按形态分类
球菌（如葡萄球菌、链球菌）。
杆菌（如芽孢杆菌、大肠杆菌）。
弧菌（如溶血弧菌、霍乱弧菌）。
螺旋菌（如钩端螺旋菌、幽门螺旋菌）。
按着色结果分类
革兰氏阳性菌（革兰氏染色显阳性，如金黄色葡萄球菌、枯草芽孢杆菌）。
革兰氏阴性菌（革兰氏染色显阴性，大肠杆菌、肺炎杆菌）。
按培养方式分类
可培养细菌。
不可培养细菌。
还有一些以特征命名的，如能产乳酸的细菌都称为乳酸菌；能形成芽孢的杆菌，都称为芽孢杆菌。
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文章来源：转自林文辉教授（池塘里的那些事儿40）
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