乡镇卫生院的绩效管理是指为实现卫生院发展目标，采用科学的方法，通过对全员医务人员的行为表现、劳动 态度和工作业绩，以及综合素质的全面监测、考核、分析和评价，充分调动医务人员积极性、主动性和创造性，不断改善其行为，从而达到提高每位医务人员的的绩效水平，并最终提高卫生院整体绩效的管理活动过程。
理想很丰满，但乡镇卫生院绩效管理中存在很多问题。很多乡镇卫生院在推行绩效管理，但是由于对绩效管理认识不清，存在理解上的偏差，再加上相关软硬条件不具备，使得绩效管理未能达到预期目标，问题重重，不仅没有带来整体地高绩效，反而带来了医务人员的反对，影响到他们的积极性。目前乡镇卫生院绩效管理存在的问题主要包括以下几个方面:
一、考核目标与医务人员个人目标错位
绩效管理的关键在于根据组织目标，结合实际将组织目标分解为部门目标，然后根据员工能力大小，在和员工共同研讨基础上合理确定员工的绩效目标。其目的在于有效将组织任务合理分配给员工，并能让员工了解自己需要 完成的工作任务，从而有目的，有计划地开展工作，在有效实现个人绩效目标基础上，最终推动组织目标的有效实现。在乡镇卫生院绩效管理过程中，一方面乡镇卫生院本身的目标不能确定，因此不能合理确定员工的具体绩效目标;另一方面由于管理者并不真正懂得绩效管理，因此忽略了目标的重要作用，而是单方面、简单地设立一个笼统的绩效标准作为医务人员绩效目标，这个目标常常不符合医务人员的具体情况，也不被医务人员所认同，导致 医务人员追求的目标与医院的发展目标、考核目标错位甚至冲突，使得绩效管理不能有效实施。
二、重考核轻过程，绩效管理不能提高医务人员绩效绩效管理是一个闭环的过程管理。当确定医务人员的绩效目标后，管理者应该对其绩效实施过程进行指导、监控，及时提供必要的帮助和支持，并随时发现问题，及时纠正偏差，以保证绩效目标的实现。在绩效管理过程中，发现员工绩效目标不合理时应及时调整目标，帮助员工达到应有的绩效水平，以激发应有的工作热情。所以，绩效 管理主要任务在于对过程的控制和管理。很多乡镇卫生院在实施绩效管理过程中，大家均忽略了对过程的调控和管理，往往重视对年终绩效的考核，并简单根据考核结果确定优劣，将绩效考核等同于绩效管理。由于只重视结果，忽略过程，使得医务人员工作没有积极性，简单追求 考核结果，而行为得不到改善，整体能力水平得不到提升，绩效因此得不到提高，乡镇卫生院整体绩效也得不到改善。
三、绩效考核评价体系不完善
乡镇卫生院的绩效考核应该在公平公正的原则下进行，它是对乡镇卫生院所有工作人员的工作过程和工作结 果的全面客观考评。然而，乡镇卫生院绩效考核采取的主 要方式是内部考核，考核主体以上级考核为主，这种自上而下的考核方式，往往带有较大的主观性，无法真实反映 出卫生院医护人员的实际工作绩效。另一方面，在考核方式上也较为单一，往往是直观性的考核，做表面的评价，使得考核结果不具备客观性和公正性。再有就是考核指标设计不合理，考核指表不健全，通常注重结果的考核，过程性指标较少，同时各类指标的权重设计不合理，并具有随意性。由于考核评价体系不完善，使得考核结果不具有 客观性和公正性，使得医务人员对考核不认同、不支持， 甚至反感，考核通常流于形式，考核结果也不能指导具体 管理实际，最终影响到绩效管理的有效开展。
四、内在动力不足，医务人员支持度差
一方面，由于医护人员对绩效管理不了解，担心绩效管理实施会增加自身工作强度，降低工资总体水平;再加上习惯了以往平均主义的工作方式，害怕竞争，因此对绩效管理持反对态度，并有意无意在思想和行为上阻碍绩效管理的实施。另一方面，医院管理者也对绩效管理持反对态度。主要原因在于一是害怕改革带来不稳定因素;二是对绩效管理本身不了解，不知道如何实施;三是受条件限制，开工不足，医务人员任务不饱满，多数医务人员实际上根本无法实现高绩效，绩效管理离开了现实基础，绩效工资也无法兑现。由于内在动力不足，使得绩效管理实施困难，只能被动的推行，随意性和变样实施表现十分突出。
五、绩效考核结果不能用于指导管理实际
绩效管理的精髓在于及时发现员工在工作中存在的问题并加以调整和改进。绩效管理是根据考核结果，将有关问题反馈给员工，将考核结果用于指导具体管理实际，以提高每一个员工的绩效水平。然而，在乡镇卫生院的绩效管理中多注重结果的考核，忽视过程考核，考核结果存入档案，或者作为绩效工资的依据，往往忽略绩效反馈，医务人员不知道工作中哪些方面存在不足，哪些地方需要改进，也不知道哪些方面做的好应该进一步发扬。而管理者 也不知道根据考核和评价结果去改进管理方法，或者指导医务人员更好开展工作，最终导致绩效考核失去意义。
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