中药加工炮制的内容十分丰富,但其所用的工具、辅料、方法并不完全适用于每一味药物,它们之间还存在一定的禁忌。
自晋代以前，除《华氏中藏经》记载过“桂不见火”，很少有其他书籍明确提出炮制禁忌要求，到了南北朝，《雷公炮炙论》才明确提出奠定了基础，一直到明、清朝才大量刊载在各类本草之中。
有相当一部分的本草，虽然没有明确提出禁忌要求，但在具体的药物项下多提出“以竹刀、铜刀切之”，“以苦竹刀切，以木臼柞捣之”，“以竹刀子切，放铜器内炒”等要求，从另一个侧面反映了加工炮制中的禁忌。
从历代典籍中可看出，这些禁忌主要有忌铁、忌铜、忌铅、忌火、忌水、忌醋、忌盐、忌牛乳、忌油脂等。其中，又以忌铁、忌火、忌铜尤为突出。明、清两代仅此3项的禁忌药物就达78种。
槟榔“勿令经火，恐无力，若熟使不如不用”；柴胡“勿令犯火，立便无效也”。——《雷公炮炙论》
丹砂“慎勿升炼，一经火炼，饵之杀人”——《炮炙大法》
姜黄“不宜见火，盖辛胜是其功用，见火则辛去矣”——《本草述钩元》
朱砂“若经火炼，则热毒等砒袍，杀人”——《修事指南》
炮制禁忌要求并不是完全一成不变的
“凡使生地黄……，勿犯铜铁器，令人肾消并发白，男损荣，女损卫也”——《雷公炮炙论》
玄参“忌铜铁，犯饵之，噎喉丧目，古人深戒”——《本草蒙签》
“且如知母、桑白皮、天冬、麦冬、生熟地黄、何首乌忌铁器……，犯铁必患三消”——《医学人门》
仙茅“勿犯铁，斑人须鬓”；《本草新编》日，何首乌“尤恶铁器，凡人诸药之中，曾经铁器者，其气味绝无功效——《炮炙大法》
石营蒲“犯铁器，令人吐逆”——《本草分经》
古代中药加工炮制中的禁忌要求，是在长期的医疗实践中逐渐形成的。如雄黄，《神农本草经》等文献多载“炼食之”，至清代才明确提出“忌火锻”。这说明在漫长的历史中，古代医家做了大量的细致观察和深人研究，才得出其科学的沦断，这些经验是十分宝贵的。
从忌火的药物来看，某些含挥发性成分的药物，在见火加热条件下，挥发油大量挥发，必然降低疗效，故要求忌火是可以理解的；朱砂、雄黄等矿物类药物经火缎后，易分解为剧毒的三氧化二砷，故古人认为见火后毒如砒硒是有科学依据的。
文献中的炮制禁忌要求并不是完全一成不变的，针对不同病人的不同用途，临床上亦常依证而施。如生槟榔多用于驱虫，经火后其有效成分槟榔碱受到破坏，驱虫作用降低，故古人提出“忌火”；而当用治食积不消、泻痢后重，则宜炒用。炒制后药性缓和，对挟虚病人，不致因克伐太过，耗损正气，且功偏消食、下气、散满。从这里可以看出，中药加工炮制的灵活性和辨证观点。
中药加工炮制中的禁忌要求，历史悠久，牵涉范围广，其科学性和实用价值，虽然不少已为现代科学所证实，但这方面的研究必竟还是太少了，还有很多未被人们所认识。应以中医药理论为指导，现代科学技术为手段，结合临床经验，进一步揭示与研究古代炮制方法的合理性、实用性和科学性，再予以肯定或否定。
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