对于这两种腹泻，可以通过一些特点来分辨，养殖户可从以下三个方面着手，分辨是病毒性腹泻还是细菌性腹泻。
一、发病的时间：
病毒性腹泻一般多发生于秋冬季节，而细菌性腹泻一年四季都有可能发生，如果现在猪场发生腹泻，那么细菌性的腹泻可能性更大。
二、发病所表现的症状：
虽说都是腹泻，但是表现出来的症状是截然不同的。
病毒性腹泻常表现出的症状是拉稀呈严重水样，仔猪会有脱水呕吐的症状，粪便多为黄色和灰黄色，常伴有腥臭味。
细菌性腹泻症状没有那么凶猛，一般只是拉稀粪，排出白色、灰白色粥样粪便或糊状粪便。病猪多表现为畏寒，行动缓慢，拱背等症状。
三、传播速度：
病毒性腹泻传播速度快，隔天可能就会全群感染，防不胜防。而感染上病毒性腹泻，死亡率也高，猪的年龄越小，死亡率越高。