鸡群发生呼吸道疾病时除出现明显症状和死亡外，其生长迟滞，生产性能下降，给养鸡业带来极大的损失。
1.当鸡群发生轻微呼吸道疾病时，即使不出现死亡，但其对鸡群的影响已经存在。肉鸡群表现生长迟缓，青年鸡群发育受到严重影响，产蛋鸡群产蛋率出现下降。鸡新城疫野毒感染产蛋鸡群，可能发生非典型ND，仅表现呼吸困难而不出现死亡，但产蛋率在一周时间内可能从90%以上下降到40%以下，一个月以后才可能恢复到80%左右。
2.当鸡群发生严重的呼吸道疾病时，会出现死亡。死亡率与鸡群日龄、体质、免疫状态、免疫抑制情况以及感染的呼吸道病原体种类、数量和毒力强弱等诸多因素有关，也与非病原体致病因子的协同作用分不开，有时可造成较高的死亡率。如禽流感、鸡新城疫等烈性传染病的病原体与其他因素共同作用，其最高死亡率可达100%。
上述两种情况，都会造成高淘汰率或高死亡率，产品的合格率下降，养鸡生产的经济效益下降，甚至出现严重的亏损。在规模鸡场，有时是毁灭性的。
3.呼吸道病致病因子对鸡的生理产生不利影响，造成鸡群体质下降。如鸡新城疫、禽流感等呼吸道病原体的弱毒株或其活疫苗毒株侵入鸡群，由于某种因素制约，不发生呼吸道疾病，但是该病原体对鸡的生理机能造成影响，也可能产生很强的免疫抑制作用，造成机体对各种疫苗的免疫应答能力下降，抵抗力降低，易发各种其他疾病，使鸡群处于亚健康状态。这种影响对鸡的个体来说是终生的。
4.鸡发生呼吸道疾病后，为了迅速控制疾病，防止疫情扩散，必然采取防治措施，包括应用药物治疗、疫苗紧急接种等，从而增加了饲养管理的难度和费用，加大了生产成本，降低经济效益。
5.多数鸡呼吸道病原体和免疫抑制病原体是畜禽共患的，它的存在和发生，给其他畜禽生产带来严重的威胁。高致病性毒株（如H5N1）不仅引起鸡发病和死亡，还能感染鸭、鹅、番鸭等禽发病，甚至可能感染其他动物，给当地畜牧业的发展带来威胁。
6.鸡群发生呼吸道疾病，严重影响产品的卫生、质量和食品安全，危害人类健康。这包括三方面：一是鸡群发生呼吸道疾病后，应用药物进行治疗，以求控制疫情，如用药不规范，可能造成药物残留，对人体产生危害。二是病原体通过粪便等途径排出体外，污染空气和环境，使空气和环境中病原体含量增高，给畜禽生产和人类带来危害。三是某些鸡呼吸道疾病的病原体可能通过禽及其产品传染给人类，造成人的感染、发病乃至死亡，严重威胁人类健康。