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现代研究发现藏红花制剂具有明显的抑癌抗癌能力，特别是藏红花萃取物二甲基藏红花酸对白血病、卵巢癌、结肠癌、横纹肌肉瘤、结肠癌、乳头肉瘤、扁平细胞瘤和软组织肉瘤等都具有较强的抑制作用。
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藏红花有活血和养血功能，在中药里是无其它药材能出其左的，藏红花的作用对于血亏体虚、月经不调、产后淤血、经闭，面部生斑，周身疼痛、忧郁闷结等症状具有明显的改善效果。使人气血活，血气旺，精神充沛，面色红润。
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藏红花还有一个功效就是调节循环系统，在常压缺氧的条件下，可增大丙酮酸的生成量，提高心肌细胞内乳酸脱氢酶活性，从而可增强细胞内的氧代谢功能，提高心脏的耐缺氧能力，在一定程度上减弱剧烈运动对心肌细胞的损伤，对心脏有一定保护作用。
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藏红花具有利胆作用，有效成分为 -藏红花酸钠盐及藏红花酸酯。藏红花酸能降低胆固醇和增加脂肪代谢，可配合山楂、草决明、泽泻等传统中药，用于脂肪肝的治疗。藏红花通过改善微循环，促进胆汁的分泌和排泄，从而降低异常增高的球蛋白和总胆红素，可用于慢性病毒性肝炎后肝硬化的治疗。
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目前认为肾小球肾炎发病机理与血小板及其释放的炎性介质有密切关系，抗血小板聚集的药物如藏红花用于干扰肾炎动物模型已取得了明显的疗效。
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临床上藏红花用于治疗人体多种慢性疾病，通过其活血化瘀、抗菌消炎的功效，增强机体耐力，增强淋巴细胞增殖反应，以此来提高机体细胞免疫和体液免疫，起到调整人体气机运行，平衡人体阴阳的作用。
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藏红花提取物特别是藏红花素能有效抑制氧自由基及黄嘌呤氧化酶的活性，表现出抗氧化生物活性。藏红花乙醇提取物可以防止乙醇引起的海马体长期增强效应的抑制。