甲亢按病因分为Graves病和自主功能性甲状腺瘤（以手术治疗为主）。甲亢（Graves病）的治疗有三种方式：内科药物治疗，放射性碘131核素治疗和手术治疗。
一、抗甲亢药物治疗 是首选的治疗方法，适应1、病情较轻，甲状腺轻、中度肿大；2、年龄在20岁以下，孕妇、老年人体弱的人或合并严重心、肝、肾疾病而不宜手术者；3、甲状腺次全切除术后而不宜放射性碘治疗者；4、放射性碘治疗的辅助治疗；5、手术前准备治疗。
抗甲状腺药物治疗的优缺点：抗甲状腺药物治疗是甲亢治疗中最常用的方法。大多数甲亢病人一般首选抗甲状腺药物作为决定性的治疗药物。本疗法既有优点也有缺点。
优点：
（1）几乎所有的病人对此类药都有肯定的疗效。
（2）药物作用有可逆性，故不引起永久性甲状腺功能减退。
（3）严重副作用少见，故较为安全。
（4）治疗方法较为简便，易被病人接受。
（5）价格较为便宜。
缺点：
（1）疗程时间过长，短者1年，长者数年。
（2）疗程结束后复发率较高，约50%的患者停药后1年内复发。疗效不如甲状腺手术或同位素治疗。
抗甲状腺药物常用的是甲硫咪唑（他巴唑）和丙基硫氧嘧啶。这两种药物控制甲亢都有较好效果且比较安全。他巴唑比较便宜。此二药主要缺点是疗程长，治疗时间短于１年者复发率可高达60%左右。必须坚持长时间服药。
抗甲状腺药物使用时，下列二药选用一种。1．他巴唑：轻症病人20至30mg／日，中度30至40mg／日，重度40至60mg／日，一般常用每日30mg分三次服。２．丙基硫氧嘧啶：0.1g／次，３次／日。近年有学者提出冲击疗法，即一次高剂量可达到强烈抑制甲状腺激素的合成。另外上药治疗到一月后要加用甲状腺片，每日20mg。如在医疗中发生药物性甲状腺功能减退，可适当加量至每日40mg，以防眼球突出加重。
治疗甲亢的抗甲状腺药物副作用
治疗甲亢的抗甲状腺药：丙硫氧嘧啶、他巴唑等可引起白细胞减少症，一般发生在用药后的头几个月，如及时停药，多在1~2周内恢复，故在用药期间要定期检查血象。
治疗甲亢的西医抗甲状腺药物治疗中最严重的副作用是白细胞减少症、粒细胞缺乏症，由于粒细胞过少全身抵抗力显著下降，继而导致全身严重的感染，对生命的威胁极大。因此，在用药期间应注意有无粒细胞缺乏症的发生，如果及时发现，治愈的机会还比较多。粒细胞缺乏症发生多在用药l一3个月期间，但也可见于用药后的任何时间。因此，在用药l一3月期间应特别警惕。
二、放射性碘治疗适应症为：
1、35岁以上，病情中等，甲状腺中度肿大者；2、对抗甲状腺药物有过敏或毒性反应而不能续用，或长期治疗无效或停药后复发；3、患者不愿手术，或有手术禁忌症，或手术后复发者。
放射性碘治疗的禁忌症：1、妊娠期和哺乳期妇女；2、年龄在20岁以下者；3、有重度肝肾功能不全者或活动性肺结核者；4、重度浸润性突眼者；5、周围血白细胞低于3000/mm或中性粒细胞低于1500/mm者。
放射性碘治疗的并发症：1、甲状功能减退；2、放射性甲状腺炎；3、个别可诱发甲状腺危象。
三、甲状腺手术治疗 适应于：1、甲状腺显著肿大，压迫邻近器官；2、甲状腺较大，经抗甲状腺药物治疗无效或停药后复发以及不能或不愿坚持服药者；3、胸骨后甲状腺肿伴甲亢或结节性甲状腺肿伴甲亢。
有以下情况的甲亢患者不适宜用甲状腺手术治疗：
（1）病情轻且甲状腺肿大程度轻，用药物治疗往往可使甲亢治愈。
（2）恶性突眼，严重的恶性突眼用手术治疗，有可能使突眼加重，但一般不重的突眼可以用手术治疗。
（3）青少年甲亢患者的身体发育不成熟，不适于手术，而且手术后复发者相对较多。
（4）老年甲亢，各脏器功能有衰退现象者。
（5）手术治疗后甲亢复发，再施行手术的难度加大，易发生手术并发症。
（6）甲亢孕妇在妊娠后期不宜手术。