市场上流通的冬虫夏草，里面通常会混杂一些有缺陷的冬虫夏草，如断的、穿竹签的和空瘪的，这样的虫草一般要经过一定的处理：刷泥、去断草、去穿条、去瘪草、按大小分类，才能出售，这个处理工作越认真细致，冬虫夏草的品质就越好，档次也就越高。
常见的瑕疵草有以下情况：
1、断草：在采挖、刷净、收储或后期销售过程中发生了折断，分成两截或多截的虫草。
2、穿条：将已断的虫草用竹签或草签穿起来，形成一个完整的冬虫夏草，并混于优质虫草中，以高价销售，在购选中，应当认真鉴别。
3、死草：冬虫夏草死掉了挖出来的即为死草。
4、瘪草：由于采挖时间晚，虫体营养被草头吸收过多从而导致虫体变瘪，甚至变空，一般情况下，瘪草伴随着草头过长的现象产生。也有后期储存不当，导致受潮化苗导致变瘪的。
5、黑草：冬虫夏草虫体表面颜色加深，呈深棕色或暗黑色。
6、空心草：在生长过程受地理自然坏境影响，致使冬虫夏草质地软化，芯部形成空腔，捏之虫体呈棉花糖具有弹性。
7、多头草：虫体头部处的子座出现多个分枝或分叉的冬虫夏草。
从虫草统货中挑选出的瑕疵草
除了瑕疵草，还有掺假的虫草，后续再做介绍。