养殖规程中，代谢产物的不完全硝化作用，易使水体氨氮升高。养殖水体氨氮过高，会损害养殖动物的肝、胰组织，降低其获氧能力，引起应激。
氨氮及其衍生物时水中重要的生态因子之一，它们对水生生物既有有害的一面，又有其有益的作用。养殖者的责任是掌握其变化规律的基础上，因势利导，限制其有害因素，使其转换为有益的物质，把生产搞得更好。
分子氨对水生动物是极毒的，而离子铵不仅无毒，还是水生植物的重要营养类。水中积累的氨，会对养殖对虾产生结构性和功能性的不良影响，损害气体交换作用，抑制基础代过程，使养殖对虾生长速率下降，降低其对环境的适应力和对污染的耐受力，减弱对疾病的抵抗能力，甚至造成养殖对虾的死亡，氨有昼夜与垂直变化，这种变化在晴天尤为显著，这主要与池水溶解氧、水温、pH变化有关。晴天中午前后表层非离子铵差大大缩小。所以，白天中午前后开机搅水，也是避免氨中毒的一个有效措施。
南美白对虾养殖水体的总氨氮应不高于2.667毫克/升，非离子氨氮应不高于0.201毫克/升。
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