微波炉已经成为日常生活的必需品，但有不少市民担心微波炉加热食物带来一定的危害。专家表示，目前在一些正式的公报上还没有证实它的有害影响。相反有一篇科学综述介绍说，微波不会对人致癌，也不会让食物产生致癌性，甚至还有助于避免食物致癌物的产生。对于鱼肉等食物来说，传统加热，尤其是烧烤方式容易产生一些致癌物质。
专家表示，传统烹煮与微波加热,二者没有可比性!只要按规范操作,正常的微波加热食物不会产生直接烧烤时那样的食物变性致癌的危害。
西兰花
西兰花是最常见的微波食物。然而，美国《食品和农业的科学杂志》刊登一项研究发现，用微波炉烹饪西兰花会导致其中抗氧化成分减少97%。而用燃气灶烹饪西兰花只会导致其中抗氧化物减少11%。
芦笋
新鲜芦笋富含包括维生素C在内的多种抗氧化营养素。挪威《斯堪的纳维亚农业学报》刊登一项新研究发现，微波炉加热会导致芦笋中维生素流失。因为维生素C和B族维生素属于水溶性维生素，稳定性更差，遇水、遇热、遇光容易遭到破坏。
大蒜
美国《营养学杂志》刊登一项研究发现，微波炉加热1分钟就会摧毁大蒜中的活性硫烯丙基化合物，使之失去应有的抗癌作用。 北京朝阳医院营养师宋新最后提醒，大部分的蔬菜尤其是绿叶菜如果用微波炉加热，都有可能存在营养素流失过多的问题，因为蔬菜中维生素C等营养素对光热较为敏感。而肉类、蛋类、主食类用微波加热，营养损失较小。