济宁市中医院始建于1959年，是全国针灸临床中心济宁分中心，省级“文明单位”、济宁市“十佳群众满意医院”。
医院坚持突出中医特色，具有完善的中医特色分级诊疗体系。医院针灸科被评为国家级中医药重点专科；预防保健科被评为省级中医药预防保健服务中心；糖尿病科、心血管病科、肾病科、脑病科、推拿科、康复科等五个科室均为省级中医药重点专科。
济宁市医院积极发挥中医药的优势带动作用，中药制剂研发工作取得突破进展。医院开展的双心同治治疗支架后遗症、应用虫类活血化瘀药治疗糖尿病肾病蛋白尿，中医脐疗、热敏灸等广泛应用于临床；研发的糖尿病足院内制剂“蛸红敛疮油”申报成功，临床使用前景良好；骨科、肿瘤科、皮肤科、肛肠科、周围血管病科试生产的外用膏剂及酊剂成功投入临床使用。
为宣扬中医药文化，推广中医技术，济宁市中医院先后邀请国医大师石学敏院士及国内多名中医专家来院坐诊讲座；面向全市各级医疗机构开展中医适宜技术培训，培训医师700余人；组织中医药文化科普宣讲进校园、进单位、进社区共计20余次，共计培训2000余人次。
近年来，进农村、进基层送医送健康已成为济宁市中医院常态工作，2018年义诊22次，为万余名基层居民免费查体。医院成立“万名保健医师进农户”工作小组，每个月三次为包保村居民查体，送医送药。
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